中国科学院大气物理研究所综合档案室成立于1997年8月。 档案工作有以下几个部分组成：科研课题研究档案、文书档案、基建档案、仪器设备档案、会计档案、声像档案、名人档案。

　　1998年8月我所档案管理工作通过院一级考评。并荣获中国科学院档案工作先进集体。

　　1999年12月我所档案工作晋升为科技事业单位档案管理国家二级。 职责范围如下：１、对本所机关各部门和研究室形成的各种文件材料和科研资料的收集、整理、立卷和归档工作进行监督和指导；２、集中统一管理机关和研究室各种门类和载体的档案并积极提供利用； ３、贯彻党和国家的保密、保卫制度，确保档案和档案机密的安全；４、承办档案鉴定、销毁、统计工作。制定档案工作的规章、制度、办法等；５、编制检索工具和文献资料，提高档案利用效率。积极开展档案应用前景研究，适时做一些专题研究，开辟档案为机关管理和科研服务的新途径；６、积极了解所内新动向，参予所内重大活动，提供档案信息服务工作； ７、负责档案日常借阅、查询工作；８、定期组织兼职档案有关人员学习档案、专业知识，负责宣传档案法规和有关文件；