创新转化基地是大气所异地内设支撑部门，定位于应用基础研究加科技成果转化，未来将紧扣大气科学和地球系统科学的学科之本，服务于大气所主要发展目标，以及地方经济社会发展的科技需求。同时承担“淮南大气科学研究院”日常管理和运行工作，该机构由淮南市人民政府举办，大气所依据协议合作共建，是淮南市直属科研事业单位。

　　主要功能和任务包括：

　　1、大气所新的学科建设和大型科学装备研制基地

　　2、江淮流域气候环境综合观测试验基地

　　3、科技成果服务地方社会经济可持续发展基地

　　4、科技成果孵化、转化及产业化基地